戴琼海院士等开发细胞显微图像与基因数据融合分析的AI方法—MUSE
基于课题组在光学显微技术，单细胞基因解析技术以及人工智能的交叉应用的积累，2022年3月28日，UCSF的Lani F. Wu、Steven J. Altschuler和清华大学戴琼海院士团队合作在Nature Biotechnology上发表了文章Integrative spatial analysis of cell morphologies and transcriptional states with MUSE，提出了细胞显微图像与基因数据融合分析的人工智能方法，在包含脑、阿兹海默症的多种生物问题研究中，展示图像与基因的融合能大幅提升我们对于复杂器官空间结构与疾病发展解析的认知能力。
科研人员开发出单细胞空间转录组数据分析可视化平台
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。
清华团队开发人工智能算法SPACE用于空间转录组数据分析
在多细胞生物体中，尽管所有细胞共享相同的基因组，但由于内部基因调控网络的差异以及与周围微环境中相邻细胞的外部信号交流，它们在形态、基因表达和功能上展现出显著的多样性。
Nature Methods | 当Hi-C拥有“空间坐标”：Spatial Hi-C揭示大脑发育中的三维基因组图谱
引言我们已经越来越清楚：基因组并不是一条摊平在细胞核里的DNA长链。染色体会在细胞核中折叠、分区并形成远距离接触，这些三维结构与基因表达、DNA复制和损伤修复密切相关。
同济大学附属同济医院王晨飞课题组开发空间转录组分析算法STRIDE
3月7日，同济大学附属同济医院王晨飞课题组在Nucleic Acids Research杂志上发表文章STRIDE: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing，开发了空间转录组与单细胞整合分析工具STRIDE，通过机器学习方法及数据整合，将空间转录组学数据提升至单细胞精度。
上海科学家提出“AI虚拟类器官”理论，让患者享受个性化精准治疗
近日，上海交通大学医学院附属新华医院苏佳灿教授团队联合上海大学团队，在生物材料领域国际顶尖期刊《生物活性材料》发表综述论文，首次系统性地提出“人工智能虚拟类器官”这一前沿概念，旨在破解生物类器官面临的问题，打造与患者器官高度一致的“数字孪生”系统。
科学家首次揭示人类胚胎尾端组织中心调控原肠运动
记者从中国科学院动物研究所获悉，该所与北京干细胞与再生医学研究院、中国农业大学等单位的科研人员合作，通过3D重构人类原肠期胚胎，首次揭示了人类胚胎尾端组织中心调控原肠运动。此项研究工作填补了原肠胚阶段人类胚胎各细胞谱系发育知识空白。
上海交大构建全时间尺度单细胞转录组图谱，揭示新的细胞代谢反应
近日，上海交大校友、华盛顿大学生物医学专业博士生李海廓，以肾脏作为研究模型，利用高通量单细胞方法，揭示了全新的细胞代谢反应。
最新研究揭示先天性巨结肠发病机制
记者从华中科技大学同济医学院附属同济医院获悉，该院小儿外科冯杰雄教授与湖北大学刘志华教授合作，利用单细胞转录组测序和空间转录组测序技术，构建了波阵面肠神经嵴细胞发育的时空分子图谱，揭示了先天性巨结肠的发病机制。相关研究成果近日发表于《发育细胞》杂志。